A reference map of the human binary protein interactome - Institut Pasteur Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Nature Année : 2020

A reference map of the human binary protein interactome

Katja Luck (1, 2) , Dae-Kyum Kim , Luke Lambourne , Kerstin Spirohn , Bridget Begg , Wenting Bian , Ruth Brignall , Tiziana Cafarelli , Francisco Campos-Laborie , Benoit Charloteaux , Dongsic Choi , Atina Coté , Meaghan Daley , Steven Deimling , Alice Desbuleux , Amélie Dricot , Marinella Gebbia , Madeleine Hardy , Nishka Kishore , Jennifer Knapp , István Kovács , Irma Lemmens , Miles Mee , Joseph Mellor , Carl Pollis , Carles Pons , Aaron Richardson , Sadie Schlabach , Bridget Teeking , Anupama Yadav , Mariana Babor , Dawit Balcha , Omer Basha , Christian Bowman-Colin , Suet-Feung Chin , Soon Gang Choi , Claudia Colabella , Georges Coppin , Cassandra D’amata , David de Ridder , Steffi de Rouck , Miquel Duran-Frigola , Hanane Ennajdaoui , Florian Goebels , Liana Goehring , Anjali Gopal , Ghazal Haddad , Elodie Hatchi , Mohamed Helmy , Yves Jacob (3) , Yoseph Kassa , Serena Landini , Roujia Li , Natascha van Lieshout , Andrew Macwilliams , Dylan Markey , Joseph Paulson , Sudharshan Rangarajan , John Rasla , Ashyad Rayhan , Thomas Rolland , Adriana San-Miguel , Yun Shen , Dayag Sheykhkarimli , Gloria Sheynkman , Eyal Simonovsky , Murat Taşan , Alexander Tejeda , Vincent Tropepe , Jean-Claude Twizere , Yang Wang , Robert Weatheritt , Jochen Weile , Yu Xia , Xinping Yang , Esti Yeger-Lotem , Quan Zhong , Patrick Aloy , Gary Bader , Javier de las Rivas , Suzanne Gaudet , Tong Hao , Janusz Rak , Jan Tavernier , David Hill (1, 2) , Marc Vidal (1, 2) , Frederick Roth (1, 4, 5, 6) , Michael Calderwood (1, 2)
Dae-Kyum Kim
  • Fonction : Auteur
Luke Lambourne
Kerstin Spirohn
Bridget Begg
  • Fonction : Auteur
Wenting Bian
  • Fonction : Auteur
Ruth Brignall
  • Fonction : Auteur
Tiziana Cafarelli
  • Fonction : Auteur
Francisco Campos-Laborie
  • Fonction : Auteur
Benoit Charloteaux
  • Fonction : Auteur
Dongsic Choi
  • Fonction : Auteur
Atina Coté
  • Fonction : Auteur
Meaghan Daley
  • Fonction : Auteur
Steven Deimling
  • Fonction : Auteur
Alice Desbuleux
  • Fonction : Auteur
Amélie Dricot
  • Fonction : Auteur
Marinella Gebbia
  • Fonction : Auteur
Madeleine Hardy
  • Fonction : Auteur
Nishka Kishore
  • Fonction : Auteur
Jennifer Knapp
  • Fonction : Auteur
István Kovács
  • Fonction : Auteur
Irma Lemmens
  • Fonction : Auteur
Miles Mee
  • Fonction : Auteur
Joseph Mellor
  • Fonction : Auteur
Carl Pollis
  • Fonction : Auteur
Carles Pons
  • Fonction : Auteur
Aaron Richardson
  • Fonction : Auteur
Sadie Schlabach
  • Fonction : Auteur
Bridget Teeking
  • Fonction : Auteur
Anupama Yadav
Mariana Babor
  • Fonction : Auteur
Dawit Balcha
  • Fonction : Auteur
Omer Basha
  • Fonction : Auteur
Christian Bowman-Colin
  • Fonction : Auteur
Suet-Feung Chin
Soon Gang Choi
Claudia Colabella
Georges Coppin
  • Fonction : Auteur
Cassandra D’amata
  • Fonction : Auteur
David de Ridder
  • Fonction : Auteur
Steffi de Rouck
  • Fonction : Auteur
Miquel Duran-Frigola
  • Fonction : Auteur
Hanane Ennajdaoui
  • Fonction : Auteur
Florian Goebels
  • Fonction : Auteur
Liana Goehring
  • Fonction : Auteur
Anjali Gopal
  • Fonction : Auteur
Ghazal Haddad
  • Fonction : Auteur
Elodie Hatchi
  • Fonction : Auteur
Mohamed Helmy
Yoseph Kassa
  • Fonction : Auteur
Serena Landini
  • Fonction : Auteur
Roujia Li
  • Fonction : Auteur
Natascha van Lieshout
  • Fonction : Auteur
Andrew Macwilliams
  • Fonction : Auteur
Dylan Markey
  • Fonction : Auteur
Joseph Paulson
Sudharshan Rangarajan
  • Fonction : Auteur
John Rasla
  • Fonction : Auteur
Ashyad Rayhan
  • Fonction : Auteur
Thomas Rolland
  • Fonction : Auteur
Adriana San-Miguel
  • Fonction : Auteur
Yun Shen
  • Fonction : Auteur
Dayag Sheykhkarimli
Gloria Sheynkman
  • Fonction : Auteur
Eyal Simonovsky
  • Fonction : Auteur
Murat Taşan
  • Fonction : Auteur
Alexander Tejeda
  • Fonction : Auteur
Vincent Tropepe
  • Fonction : Auteur
Jean-Claude Twizere
Yang Wang
  • Fonction : Auteur
Robert Weatheritt
  • Fonction : Auteur
Jochen Weile
  • Fonction : Auteur
Yu Xia
Xinping Yang
  • Fonction : Auteur
Esti Yeger-Lotem
Quan Zhong
Patrick Aloy
  • Fonction : Auteur
Gary Bader
Javier de las Rivas
Suzanne Gaudet
  • Fonction : Auteur
Tong Hao
Janusz Rak
Jan Tavernier
  • Fonction : Auteur

Résumé

Global insights into cellular organization and genome function require comprehensive understanding of the interactome networks that mediate genotype–phenotype relationships1,2. Here we present a human ‘all-by-all’ reference interactome map of human binary protein interactions, or ‘HuRI’. With approximately 53,000 protein–protein interactions, HuRI has approximately four times as many such interactions as there are high-quality curated interactions from small-scale studies. The integration of HuRI with genome3, transcriptome4 and proteome5 data enables cellular function to be studied within most physiological or pathological cellular contexts. We demonstrate the utility of HuRI in identifying the specific subcellular roles of protein–protein interactions. Inferred tissue-specific networks reveal general principles for the formation of cellular context-specific functions and elucidate potential molecular mechanisms that might underlie tissue-specific phenotypes of Mendelian diseases. HuRI is a systematic proteome-wide reference that links genomic variation to phenotypic outcomes.

Dates et versions

pasteur-04098559 , version 1 (16-05-2023)

Identifiants

Citer

Katja Luck, Dae-Kyum Kim, Luke Lambourne, Kerstin Spirohn, Bridget Begg, et al.. A reference map of the human binary protein interactome. Nature, 2020, 580 (7803), pp.402-408. ⟨10.1038/s41586-020-2188-x⟩. ⟨pasteur-04098559⟩
22 Consultations
0 Téléchargements

Altmetric

Partager

Gmail Facebook X LinkedIn More