 |
Journal articles
A virus‐derived microRNA targets immune response genes during SARS‐CoV‐2 infection
Meetali Singh
1
Maxime Chazal
2
Piergiuseppe Quarato
1
Loan Bourdon
1
Christophe Malabat
3
Thomas Vallet
4
Marco Vignuzzi
4
Sylvie van der Werf
5, 6
Sylvie Behillil
5, 6
Flora Donati
5, 6
Nathalie Sauvonnet
7
Giulia Nigro
8
Maryline Bourgine
9
Nolwenn Jouvenet
2, *
Germano Cecere
1, *
*
Corresponding author
2
Signalisation antivirale - Virus sensing and signaling
Institut Pasteur [Paris], CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR 3569
Meetali Singh 1
Author ORCID : https://orcid.org/0000-0002-5783-073X
Maxime Chazal 2
Author ORCID : https://orcid.org/0000-0002-3144-5032
Piergiuseppe Quarato 1
Author ORCID : https://orcid.org/0000-0003-3839-3383
Loan Bourdon 1
Author
Christophe Malabat 3
Author
Thomas Vallet 4
Author ORCID : https://orcid.org/0000-0001-7775-7448
Marco Vignuzzi 4
Author
Sylvie van der Werf 5, 6
Author ORCID : https://orcid.org/0000-0002-1148-4456
Sylvie Behillil 5, 6
Author
Flora Donati 5, 6
Author IdHAL : flora-donati ORCID : https://orcid.org/0000-0003-2862-9751
Nathalie Sauvonnet 7
Author IdHAL : nathalie-sauvonnet ORCID : https://orcid.org/0000-0003-0306-3376
Giulia Nigro 8
Author
Maryline Bourgine 9
Author IdHAL : maryline-bourgine ORCID : https://orcid.org/0000-0002-8850-8073
Nolwenn Jouvenet 2
Correspondent author ORCID : https://orcid.org/0000-0001-6103-6048
Germano Cecere 1
Correspondent author IdHAL : germano-cecere ORCID : https://orcid.org/0000-0001-5912-3417
1
Mécanismes de l'Hérédité épigénétique / Mechanisms of epigenetic inheritance (Département de Biologie du Développement et Cellules Souches - 25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
- Institut Pasteur [Paris] (25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR3738 (France)
2
Signalisation antivirale - Virus sensing and signaling (Département Virologie - 25-28 rue du Docteur Roux 75724 Paris cedex 15 - France)
- Institut Pasteur [Paris] (25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR 3569 (France)
3
Hub Bioinformatique et Biostatistique - Bioinformatics and Biostatistics HUB (Département de biologie computationnelle (ex C3BI), 25-28 rue du Docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
- Institut Pasteur [Paris] (25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : USR3756 (France)
4
Populations virales et Pathogenèse - Viral Populations and Pathogenesis (Département de Virologie, 25-28 rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
- Institut Pasteur [Paris] (25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR3569 (France)
5
GMV-ARN (UMR_3569 / U-Pasteur_2) - Génétique Moléculaire des Virus à ARN - Molecular Genetics of RNA Viruses (Département de Virologie, 25-28 rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR_3569 (France)
- Institut Pasteur [Paris] (25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
- UP - Université de Paris : U-Pasteur_2 (85 boulevard Saint-Germain 75006 Paris - France)
6
CNR - Centre National de Référence des virus des infections respiratoires (dont la grippe) - National Reference Center Virus Influenzae [Paris] (Unité de Génétique Moléculaire des Virus à ARN
25-28, rue du Docteur Roux - 75724 PARIS CEDEX 15 - France)
- Institut Pasteur [Paris] (25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
7
BCI - Département de Biologie cellulaire et infection - Department of Cell Biology and infection (25-28 rue du Dr Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
- Institut Pasteur [Paris] (25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
8
Microenvironnement et Immunité - Microenvironment and Immunity (Département d'Immunologie, 25-28 rue du docteur Roux, 75724 Paris Cedex 15 - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1224 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
- Institut Pasteur [Paris] (25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
9
Laboratoire commun Pasteur-TheraVectys (25-28 Rue du Dr Roux, 75015 Paris, France - France)
- Institut Pasteur [Paris] (25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
- TheraVectys (Institut Pasteur 28 Rue du Dr Roux, 75015 Paris - France)
Abstract : SARS-CoV-2 infection results in impaired interferon response in patients with severe COVID-19. However, how SARS-CoV-2 interferes with host immune responses is incompletely understood. Here, we sequence small RNAs from SARS-CoV-2-infected human cells and identify a microRNA (miRNA) derived from a recently evolved region of the viral genome. We show that the virus-derived miRNA produces two miRNA isoforms in infected cells by the enzyme Dicer, which are loaded into Argonaute proteins. Moreover, the predominant miRNA isoform targets the 3'UTR of interferon-stimulated genes and represses their expression in a miRNA-like fashion. Finally, the two viral miRNA isoforms were detected in nasopharyngeal swabs from COVID-19 patients. We propose that SARS-CoV-2 can potentially employ a virus-derived miRNA to hijack the host miRNA machinery, which could help to evade the interferon-mediated immune response.
Document type :
Journal articles
Domain :
Complete list of metadata
https://hal-pasteur.archives-ouvertes.fr/pasteur-03514377
Contributor : Germano Cecere Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Thursday, January 6, 2022 - 11:45:20 AM
Last modification on : Thursday, January 13, 2022 - 1:07:03 PM
Contributor : Germano Cecere Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Thursday, January 6, 2022 - 11:45:20 AM
Last modification on : Thursday, January 13, 2022 - 1:07:03 PM
Licence
Distributed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License
Identifiers
- HAL Id : pasteur-03514377, version 1
- DOI : 10.15252/embr.202154341
- PUBMED : 34914162
Collections
PASTEUR | UP-SCIENCES | CNRS | UNIV-PARIS | INSERM
Citation
Meetali Singh, Maxime Chazal, Piergiuseppe Quarato, Loan Bourdon, Christophe Malabat, et al.. A virus‐derived microRNA targets immune response genes during SARS‐CoV‐2 infection. EMBO Reports, EMBO Press, 2021, pp.e54341. ⟨10.15252/embr.202154341⟩. ⟨pasteur-03514377⟩
Metrics
Les métriques sont temporairement indisponibles