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Journal articles
Large-scale Exploration of Growth Inhibition Caused by Overexpression of Genomic Fragments in Saccharomyces cerevisiae
Jeanne Boyer
1, *
Gwenaël Badis
1, 2
Cécile Fairhead
1
Emmanuel Talla
3, 1
Florence Hantraye
2
Emmanuelle Fabre
1
Gilles Fischer
1
Christophe Hennequin
4, 1
Romain Koszul
1
Ingrid Lafontaine
1
Odile Ozier-Kalogeropoulos
1
Miria Ricchetti
1, 5
Guy-Franck Richard
6
Agnès Thierry
6
Bernard Dujon
6
Jeanne Boyer 1
Correspondent author
Gwenaël Badis 1, 2
Author IdHAL : gwenael-badis-breard ORCID : https://orcid.org/0000-0003-2078-3076
Cécile Fairhead 1
Author
Emmanuel Talla 3, 1
Author
Florence Hantraye 2
Author
Emmanuelle Fabre 1
Author
Gilles Fischer 1
Author IdHAL : gilles-fischer ORCID : https://orcid.org/0000-0001-5732-2682
Christophe Hennequin 4, 1
Author
Romain Koszul 1
Author IdHAL : romain-koszul ORCID : https://orcid.org/0000-0002-3086-1173
Ingrid Lafontaine 1
Author
Odile Ozier-Kalogeropoulos 1
Author
Miria Ricchetti 1, 5
Author
Guy-Franck Richard 6
Author IdHAL : gfrichar ORCID : https://orcid.org/0000-0002-8233-3532
Agnès Thierry 6
Author
Bernard Dujon 6
Author
1
Génétique Moléculaire des Levures (25-28 rue du Docteur Roux 75724 PARIS Cedex 15 - France)
- UPMC - Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (4 place Jussieu - 75005 Paris - France)
- Institut Pasteur [Paris] (25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : URA2171 (France)
2
Génétique des Interactions Macromoléculaires (25-28 rue du Docteur Roux, F-75724 Paris Cedex 15 - France)
- Institut Pasteur [Paris] (25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : URA2171 (France)
3
LCB - Laboratoire de chimie bactérienne (31 Chemin Joseph Aiguier 13402 MARSEILLE CEDEX 20 - France)
- AMU - Aix Marseille Université : UMR7283 (Aix-Marseille Université Jardins du Pharo 58 Boulevard Charles Livon 13284 Marseille cedex 7 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7283 (France)
4
Service de Parasitologie - Mycologie [CHU Saint-Antoine] (184, rue du Faubourg Saint-Antoine 75012 Paris - France)
- AP-HP - Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (France)
- CHU Saint-Antoine [AP-HP] (184, rue du Faubourg Saint-Antoine
75571 Paris cedex 12 - France)
- AP-HP - Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (France)
- Sorbonne Université (France)
5
Génétique et Biochimie du Développement (25-28 rue du Docteur Roux, F-75724 Paris Cedex 15 - France)
- Institut Pasteur [Paris] (25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : URA2581 (France)
6
Génétique Moléculaire des Levures (25 rue du Docteur Roux 75724 PARIS Cedex 15 - France)
- UPMC - Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (4 place Jussieu - 75005 Paris - France)
- Institut Pasteur [Paris] (25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR3525 (France)
Abstract : We have screened the genome of Saccharomyces cerevisiae for fragments that confer a growth-retardation phenotype when overexpressed in a multicopy plasmid with a tetracycline-regulatable (Tet-off) promoter. We selected 714 such fragments with a mean size of 700 base-pairs out of around 84,000 clones tested. These include 493 in-frame open reading frame fragments corresponding to 454 distinct genes (of which 91 are of unknown function), and 162 out-of-frame, antisense and intergenic genomic fragments, representing the largest collection of toxic inserts published so far in yeast.
Document type :
Journal articles
Domain :
Complete list of metadata
https://hal-pasteur.archives-ouvertes.fr/pasteur-02868108
Contributor : Romain Koszul Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Monday, June 15, 2020 - 12:14:17 PM
Last modification on : Tuesday, December 22, 2020 - 12:26:05 PM
Contributor : Romain Koszul Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Monday, June 15, 2020 - 12:14:17 PM
Last modification on : Tuesday, December 22, 2020 - 12:26:05 PM
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Distributed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License
Identifiers
- HAL Id : pasteur-02868108, version 1
- PUBMED : 15345056
- DOI : 10.1186/gb-2004-5-9-r72
- PUBMEDCENTRAL : PMC522879
Citation
Jeanne Boyer, Gwenaël Badis, Cécile Fairhead, Emmanuel Talla, Florence Hantraye, et al.. Large-scale Exploration of Growth Inhibition Caused by Overexpression of Genomic Fragments in Saccharomyces cerevisiae. Genome Biology, BioMed Central, 2004, 5 (9), pp.R72. ⟨10.1186/gb-2004-5-9-r72⟩. ⟨pasteur-02868108⟩
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