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Journal articles
Insights into the Host Range, Genetic Diversity, and Geographical Distribution of Jingmenviruses
Sarah Temmam
1
Thomas Bigot
1, 2
Delphine Chrétien
1
Mathilde Gondard
3, 4
Philippe Pérot
1
Virginie Pommelet
5
Evelyne Dufour
6
Stéphane Petres
6
Elodie Devillers
4
Thavry Hoem
7
Valérie Pinarello
3
Vibol Hul
7
Khamsing Vongphayloth
5
Jeffrey Hertz
8
Irène Loiseau
1
Marine Dumarest
1
Veasna Duong
7
Muriel Vayssier-Taussat
4
Marc Grandadam
5
Emmanuel Albina
3
Philippe Dussart
7
Sara Moutailler
4
Julien Cappelle
3, 7, 9
Paul Brey
5
Marc Eloit
1, 10, 11, *
*
Corresponding author
Sarah Temmam 1
Author
Thomas Bigot 1, 2
Author IdHAL : thomas-bigot ORCID : https://orcid.org/0000-0001-8504-4675
Delphine Chrétien 1
Author
Mathilde Gondard 3, 4
Author
Philippe Pérot 1
Author IdHAL : philippe-perot ORCID : https://orcid.org/0000-0002-5194-8200
Virginie Pommelet 5
Author
Evelyne Dufour 6
Author
Stéphane Petres 6
Author IdHAL : stephane-petres ORCID : https://orcid.org/0000-0002-4716-565X
Khamsing Vongphayloth 5
Author
Jeffrey C Hertz 8
Author
Irène Loiseau 1
Author
Marine Dumarest 1
Author
Veasna Duong 7
Author
Muriel Vayssier-Taussat 4
Author
Marc Grandadam 5
Author
Emmanuel Albina 3
Author
Philippe Dussart 7
Author IdHAL : philippe-dussart ORCID : https://orcid.org/0000-0002-1931-3037
Sara Moutailler 4
Author
Julien Cappelle 3, 7, 9
Author
Paul T Brey 5
Author
Marc Eloit 1, 10, 11
Correspondent author IdHAL : marceloitpasteurfr
1
Découverte de Pathogènes - Pathogen Discovery (Département de Biologie cellulaire et Infection, 25-28 rue du docteur Roux, 75724 Paris Cedex 15 - France)
- Biologie des Infections - Biology of Infection (Département de Biologie cellulaire et Infection, 25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris Cedex 15 - France)
- Institut Pasteur [Paris] (25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1117 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
2
Hub Bioinformatique et Biostatistique - Bioinformatics and Biostatistics HUB (C3BI, 25-28 rue du Docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
- Institut Pasteur [Paris] (25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : USR3756 (France)
3
UMR ASTRE - Animal, Santé, Territoires, Risques et Ecosystèmes (TA A-117 / E - Campus international de Baillarguet 34398 Montpellier Cedex 5, France - France)
- Cirad - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement : UMR117 (Siège 42, rue Scheffer 75116 Paris - France)
- INRA - Institut National de la Recherche Agronomique (France)
4
BIPAR - Biologie moléculaire et immunologie parasitaires et fongiques (INRA-Anses-ENVA
14, rue Pierre et Marie Curie
94706 Maisons-Alfort Cedex - France)
- Laboratoire de santé animale, sites de Maisons-Alfort et de Dozulé (14, rue Pierre et Marie Curie 94706 Maisons-Alfort Cedex - France)
- ANSES - Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (14 rue Pierre et Marie Curie 94701 MAISONS-ALFORT Cedex - France)
- ANSES - Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (14 rue Pierre et Marie Curie 94701 MAISONS-ALFORT Cedex - France)
- INRA - Institut National de la Recherche Agronomique : UR0956 (France)
- ENVA - École nationale vétérinaire d'Alfort (7 avenue du Général de Gaulle - 94700 Maisons Alfort - France)
- UPEC UP12 - Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (61 avenue du Général de Gaulle - 94010 Créteil cedex - France)
5
Institut Pasteur du Laos (Samsenthai Road, Ban Kao-Gnot, Sisattanak district, P.O Box 3560, Vientiane, Lao PDR. - Laos)
- RIIP - Réseau International des Instituts Pasteur (25, rue du Dr Roux 75724 Paris Cedex 15 - France)
6
PPR - Plateforme technologique Production et purification de protéines recombinantes – Production and Purification of Recombinant Proteins Technological Platform (Centre de Ressources et Recherches technologiques (C2RT) - Département Biologie structurale et Chimie - France)
- Institut Pasteur [Paris] (25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR3528 (France)
7
Institut Pasteur du Cambodge (BP 983 - 5 , Boulevard Monivong, Phnom Penh - Cambodia)
- RIIP - Réseau International des Instituts Pasteur (25, rue du Dr Roux 75724 Paris Cedex 15 - France)
8
US Naval Medical Research Unit n°2 (Phnom Penh - Cambodia)
9
UMR EPIA - Unité Mixte de Recherche d'Épidémiologie des maladies Animales et zoonotiques (Route de Theix - 63122 Saint-Genès-Champanelle - France)
- INRA - Institut National de la Recherche Agronomique : 0346 (France)
- VAS - VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (Université de Lyon, VetAgro Sup, 69280 Marcy l'Etoile (campus vétérinaire); Université de Clermont, VetAgro Sup, 63370 Lempdes (campus agronomique) - France)
10
ENVA - École nationale vétérinaire d'Alfort (7 avenue du Général de Gaulle - 94700 Maisons Alfort - France)
11
UPE - Université Paris-Est (6-8 avenue Blaise-Pascal
Cité Descartes - Champs-sur-Marne
77455 Marne-la-Vallée - France)
Abstract : Jingmenvirus is a recently identified group of segmented RNA viruses phylogenetically linked with unsegmented Flaviviridae viruses. Primarily identified in various tick genera originating in China, Jingmenvirus geographical distribution has rapidly expanded to cover Africa, South America, Caribbean, and Europe. The identification of Jingmen-related viruses in various mammals, including febrile humans, opens the possibility that Jingmenviruses may be novel tick-borne arboviruses. In this study, we aimed at increasing knowledge of the host range, genetic diversity, and geographical distribution of Jingmenviruses by reporting for the first time the identification of Jingmenviruses associated with Rhipicephalus microplus ticks originating in the French Antilles (Guadeloupe and Martinique islands), with Amblyomma testudinarium ticks in Lao PDR, and with Ixodes ricinus ticks in metropolitan France, and from urine of Pteropus lylei bats in Cambodia. Analyses of the relationships between the different Jingmenvirus genomes resulted in the identification of three main phylogenic subclades, each of them containing both tick-borne and mammal-borne strains, reinforcing the idea that Jingmenviruses may be considered as tick-borne arboviruses. Finally, we estimated the prevalence of Jingmenvirus-like infection using luciferase immunoprecipitation assay screening (LIPS) of asymptomatic humans and cattle highly exposed to tick bites. Among 70 French human, 153 Laotian human, and 200 Caribbean cattle sera tested, only one French human serum was found (slightly) positive, suggesting that the prevalence of Jingmenvirus human and cattle infections in these areas is probably low.
Document type :
Journal articles
Domain :
Complete list of metadata
https://hal-pasteur.archives-ouvertes.fr/pasteur-02355017
Contributor : Sarah Temmam <>
Submitted on : Friday, November 8, 2019 - 8:53:51 AM
Last modification on : Thursday, June 10, 2021 - 5:20:02 PM
Long-term archiving on: : Sunday, February 9, 2020 - 8:30:50 PM
Contributor : Sarah Temmam <>
Submitted on : Friday, November 8, 2019 - 8:53:51 AM
Last modification on : Thursday, June 10, 2021 - 5:20:02 PM
Long-term archiving on: : Sunday, February 9, 2020 - 8:30:50 PM
File
mSphere-2019-Temmam-e00645-19....
Publication funded by an institution
Licence
Distributed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License
Identifiers
- HAL Id : pasteur-02355017, version 1
- PUBMED : 31694898
- DOI : 10.1128/mSphere.00645-19
- PRODINRA : 492762
- WOS : 000506191700020
Collections
Citation
Sarah Temmam, Thomas Bigot, Delphine Chrétien, Mathilde Gondard, Philippe Pérot, et al.. Insights into the Host Range, Genetic Diversity, and Geographical Distribution of Jingmenviruses. MSphere, American Society for Microbiology., 2019, 4 (6), pp.e00645-19. ⟨10.1128/mSphere.00645-19⟩. ⟨pasteur-02355017⟩
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