S. Baker, Science, vol.347, pp.1064-1066, 2015.

V. M. Costa, C. E. King, L. Kalan, M. Morar, W. W. Sung et al., Nature, vol.477, pp.457-461, 2011.

E. P. Abraham and E. Chain, Rev. Infect. Dis, vol.10, pp.677-678, 1988.

K. Lewis, Nat. Rev. Drug Discov, vol.12, pp.371-387, 2013.

J. L. Gardy and N. J. Loman, Nat. Rev. Genet, vol.19, pp.9-20, 2018.

J. R. Fitzgerald and M. T. Holden, Annu. Rev. Microbiol, vol.70, pp.459-478, 2016.

C. P. Harkins, Genome Biol, vol.18, p.130, 2017.

M. T. Holden, L. Hsu, K. Kurt, L. A. Weinert, A. E. Mather et al., Genome Res, vol.23, pp.653-664, 2013.

M. Baym, T. D. Lieberman, E. D. Kelsic, R. Chait, R. Gross et al., Science, vol.353, pp.1147-1151, 2016.

A. L. Manson, Nat. Genet, vol.49, pp.395-402, 2017.

T. Song, Y. Park, I. C. Shamputa, S. Seo, S. Y. Lee et al., Mol. Microbiol, vol.91, pp.1106-1119, 2014.

S. Baker, P. T. Duy, T. V. Nga, T. T. Dung, V. V. Phat et al., , vol.2, p.1229, 2013.

W. Loftie-eaton, K. Bashford, H. Quinn, K. Dong, J. Millstein et al., Nat. Ecol. Evol, vol.1, pp.1354-1363, 2017.

A. J. Mathers, G. Peirano, and J. D. Pitout, Clin. Microbiol. Rev, vol.28, pp.565-591, 2015.

K. L. Wyres and K. E. Holt, Trends Microbiol, vol.24, pp.944-956, 2016.

A. Cassini, PLOS Med, vol.13, p.1002150, 2016.

T. P. Lim, R. T. Ong, P. Hon, J. Hawkey, K. E. Holt et al., Antimicrob. Agents Chemother, vol.59, pp.7899-7902, 2015.

B. P. Howden, A. Y. Peleg, and T. P. Stinear, Infect. Genet. Evol, vol.21, pp.575-582, 2014.

K. Holt, Microb. Genom, vol.2, p.52, 2016.

V. K. Wong, S. Baker, D. J. Pickard, J. Parkhill, A. J. Page et al., Nat. Genet, vol.47, pp.632-639, 2015.

K. E. Holt, Nat. Genet, vol.44, pp.1056-1059, 2012.

H. and C. The, PLOS Med, vol.13, p.1002055, 2016.

D. A. Lewis, Sex. Transm. Infect, vol.89, pp.47-51, 2013.

M. Unemo and W. M. Shafer, Clin. Microbiol. Rev, vol.27, pp.587-613, 2014.

Y. H. Grad, Lancet Infect. Dis, vol.14, pp.220-226, 2014.

J. Hadfield, Genome Res, vol.27, pp.1220-1229, 2017.

S. K. Dritz and A. F. Back, N. Engl. J. Med, vol.291, p.1194, 1974.

K. S. Baker, Lancet Infect. Dis, vol.15, pp.913-921, 2015.

N. Datta, J. Hyg. (Lond.), vol.60, pp.301-310, 1962.

E. S. Anderson, BMJ, vol.3, pp.333-339, 1968.

A. Tran-dien, S. L. Hello, C. Bouchier, and F. Weill, Lancet Infect. Dis, vol.18, pp.207-214, 2018.

E. J. Threlfall, J. Antimicrob. Chemother, vol.46, pp.7-10, 2000.

M. Helms, S. Ethelberg, and K. Mølbak, Emerg. Infect. Dis, vol.11, pp.859-867, 2005.

A. E. Mather, Science, vol.341, pp.1514-1517, 2013.

K. L. Hopkins, Euro Surveill, vol.15, p.19580, 2010.

E. Elnekave, Clin. Infect. Dis, vol.5, pp.877-885, 2017.

M. L. Cohen and R. V. Tauxe, Science, vol.234, pp.964-969, 1986.

S. and L. Hello, Lancet Infect. Dis, vol.13, pp.672-679, 2013.

M. Baym, L. K. Stone, and R. Kishony, Science, vol.351, p.3292, 2016.

P. J. Van-duijn, Lancet Infect. Dis, vol.18, pp.401-409, 2018.